Errata, korrigeringer etc

Uke 11

• ?velse 5 har en uheldig flertal for 'square' i beskrivelsen, siden meningen er at man bare skal skrive ut en linje. Riktig er:

Instead, use an if-test to only print the number of the first square where the amount of rice is more than one kilogram

• ?velse 6: sekvensene som skal brukes har verken start eller stop codon. Det er meningen at de skal tranlateres fra f?rste codon, i f?rste leseramme.

Uke 10

• oblig: 'Adenosine' skulle v?rt 'Adenine'
• ?velse 3b, 'Desired output' inneholder en feil. Riktig er:

There were 4 positive values and 3 negative values and 2 zeros

Uke 9

• ?velse 2b: i koden brukes my_dna = 'AACCGGAATTCCGGTTAACCGGTT' som f?rer til fragmentene ['GGAATTCC', 'GGTTAACC', 'GGTTAACC']. Men, i teksten over brukes feil DNA string, den skulle ogs? v?rt 'AACCGGAATTCCGGTTAACCGGTT'. Riktig er:

Now imagine performing a restriction digestion of a short circular piece of DNA AACCGGAATTCCGGTTAACCGGTT with three cut sites CG where the enzyme cuts between the C and the G. The resulting fragments will be (check this!):

['GGAATTCC', 'GGTTAACC', 'GGTTAACC'].

• ?velse 3c har en feil i koden helt p? slutten som lager gelbildet: det brukes to ganger fragments_insert_1 der den andre b?r v?re fragments_insert_2. Korrekt er:

fragments = {"plasmid": fragments_plasmid,
             "with_insert_1": fragments_insert_1,
             "with_insert_2": fragments_insert_2}
plot_gel_electrophoresis(fragments)
show()

Uke 6

• ?velse 3a:

Collect all the code necessary in one codecell and use it to run the python, recreating figure 5.3

Riktig figur er den p? side 161:

Collect all the code necessary in one codecell and use it to run the python, recreating the figure on page 161 in the book.

• ?velse 3d:

Compare the number of lines of python code inside the for-loop in both models. Use a markdown cell for your answer with an unordered list like this:

• The original for-loop ...
• The for-loop of the python implementation ...

En bedre formulering er

• The original for-loop ...
• The for-loop of the python implementation of the difference equation ...

• ?velse 3e:

Have the subplots appear next to each other, but below each other.

Should have been

Have the subplots appear next to each other, not below each other

• ?velse 5c: l?sningsforslaget mangler en int(), riktig er:

print("In month", n + 1, "there are", int(rabbit_pairs[n]), "rabbit pairs.")

• ?velse 5d:

Print out the number of rabbit pairs between month 3 and 5 (including) by slicing the list (not by using a for-loop).

Korrekt er "slicing the array"

Uke 4

• ?velse 4 i 04.exercises.ipynb, python kode for l?sningsforslag til a1) skulle v?rt delta_E = (E_logistic[n-1]/K) * E_logistic[n-1]

Uke 3

• 03.oblig.ipynb: dette er viktig ? ha med n?r du skal l?se oppgaven: "The loop should go over the radiuses, and the calculations of the volume, surface area and ratios should be done inside of the loop."
• Notebook varianten av kapittel 3 ser ut til ? mangle 'Summary' avsnittet som er i PDFen. Men teksten er der, men ble dessverr ikke riktig formattert. I teksten under figur 9 finnere dere ¡°# 9 Summary In this chapter¡­¡± og "## 9.1 Arrays". Disse skulle ble formattert som avsnitt tittel. Fra avsnitt 9.2 er alt i orden igjen.

Uke 2

• I formel 14 i notebooken, som er 2.14 i PDFen, st?r det to ganger en g der det skulle st?tt en a.
• 02.exercises.ipynb Oppgave 3 henviser til figure 2.19 i boken. Dette er figur 9 i notebooken. For deloppgave 3a), bruk data i filen ecoli_all.csv.
• 02.exercises.ipynb deloppgave 8a) nevner diameter i stedet for radius. Deloppgave c) har en feil i tallene, det st?r 2 og 2.0. Riktig er:

0.5, 1, 1.5, 2, 2.5, 3, 3.5 and 4 meter.

• I oblig'en, 02.oblig.ipynb, deloppgave d) er det ment 'not', ikke 'now:

d) Pretend you do not know what the index number of the value 64 is. Use the appropriate code for finding it, and print it to the screen.

Uke 1

• 01.oblig.ipynb Deloppgave b) bruker 'size', mens det b?r v?re 'volume':

Use your program to calculate the volume of the average bacterial cell.