Om BIOS1100

BIOS1100 har en standardisert emnebeskrivelse, men her f?lger en litt mer detaljert beskrivelse av undervisningsopplegget.

Beregningsorientert biologi og 'CSE'-prosjektet

BIOS1100 er et resultat av det som kalles "Beregningsorientert utdanning" p? Institutt for Biovitenskap (IBV). Beregningsorientert utdanning, eller "Computing in Science Education" (CSE)-prosjektet har som m?l ? integrere realistiske problemstillinger for studentene allerede i begynnerutdanningen. Fra websidene:

Studentene f?r gjennom beregningsorientert utdanning praktiske ferdigheter b?de i det ? bruke ferdig programvare for beregninger og selv ? programmere beregninger. Det er viktig at beregningsperspektivet kommer inn tidlig i utdanningen, helst i f?rste semester. Slik kan beregninger utnyttes og videref?res i de senere semestrene.

Prosjektet har blitt et fokus i bachelorutdanningen p? flere institutter ved Det matematisk-naturvitenskapelig fakultet de siste ?rene, og f?r med BIOS1100 sin f?rste implementering p? IBV.

Et viktig element av v?r tiln?rming til beregningsorientert biologiundervisning er ? blande biologien med programmering og matematikk fra f?rste stund, heller enn ? undervise disse elementer hver for seg. Emnebeskrivelsen til BIOS1100 beskriver det slik:

Datamaskinen og programmeringsspr?ket Python blir brukt for ? lage et virtuelt biologisk laboratorium for ? finne svar p? sp?rsm?l hentet fra genetikk, evolusjon, ?kologi og bioinformatikk.

L?rebok

Det er skrevet en egen l?rebok for BIOS1100, men boken er fortsatt delvis under utvikling. Boken blir ikke sendt til trykkeriet f?r etter h?stsemesteret 2017. Vi kommer til ? dele ut boken kapittelvis, noen ganger som delkapitler, i l?pet av kurset. Materialet gj?res tilgjengelig i PDF-format og som en s?kalt interaktiv Jupyter Notebook, med samme innhold. Forskjellen er at notebooken er interaktiv, som betyr at du kan jobbe med stoffet p? en mer aktiv m?te. Se denne siden for mer informasjon om Jupyter Notebook.

OBS Det forventes at studentene har g?tt gjennom ukens kapittel - fortrinnsvis i notebookformat - f?r forelesningen (eller i hvert fall f?r gruppetimen).

Undervisningen

Forelesningen

En vanlig forelesningen er delt i to:

1. Sjekk av begrepsforst?else fra forrige uke, samt ?velser fra gruppetimen.
2. Introduksjon av nytt stoff. Noen viktige aspekter fra ukens kapittel blir behandlet, men kapittelet blir ikke gjennomg?tt i sin helhet.

Forelesningsmaterialet blir gjort tilgjengelig via disse websidene (vi bruker ikke Fronter i BIOS1100).

Gruppeundervisningen

I tillegg til plenumsundervisningen er det fire timer gruppe?velser p? datalabben 3127 med hjelpel?rere til stede. P? gruppetimene blir forst?else av ukens stoff testet og utdypet, bl.a. ved hjelp av en rekke ?velser i Jupyter Notebook. Noen ?velser gj?res i par eller sm? team.

NB: Det er obligatorisk oppm?te p? gruppe?velsene de f?rste fire ukene.

Mot slutten av gruppetimen er det mulighet for ? jobbe med ukens obligatoriske oppgaver og/eller med notebook fra neste ukens kapittel.

Piazza: virtuelt forum

I tillegg til veiledning p? gruppetimene kan du f? hjelp ved ? stille faglige sp?rsm?l p? kursets forum: https://piazza.com/uio.no/fall2017/bios1100. Mer administrative, personlige sp?rsm?l, f.eks. ved sykdom og man ikke har f?tt levert obligatoriske oppgaver, skal rettes til kursets epostadresse bios1100 - at - ibv.uio.no.

Samarbeid

(Denne teksten er basert p? informasjon skrevet for studenter som tar begynnerfag i programmering p? informatikkprogrammet p? UiO).

Det kan v?re sv?rt utbytterikt ? Öйú¾º²ÂÍø_Öйú×ã²ÊÍø-×ãÇòÍƼöe med andre, men det kan ogs? v?re et effektiv hinder for ? oppn? egen forst?else og mestring. Det er viktig at du tidlig som student har et helt bevisst forhold til n?r og hvordan du skal Öйú¾º²ÂÍø_Öйú×ã²ÊÍø-×ãÇòÍƼöe og n?r du b?r studere p? egenh?nd. Erfaring viser at i en gruppe som Öйú¾º²ÂÍø_Öйú×ã²ÊÍø-×ãÇòÍƼöer om oppgaver og der kunnskapsniv?et blant studentene varier mye, vil den faglig sterkeste ha stort utbytte av Öйú¾º²ÂÍø_Öйú×ã²ÊÍø-×ãÇòÍƼöet gjennom ? lede oppgavel?sningen og forklare andre. De svakeste vil fort ende opp i en "skrive av"-situasjon der de ikke f?r nok tid til ? forst? det som foreg?r. Med etterarbeiding av oppgavel?sningen p? egenh?nd der man trenger dypt inn i detaljene og pr?ver ? forst? dem, s? kan dette v?re en god form for l?ring. Dessverre erfarer vi at en del ender opp med bare ? "skrive av".

Programmering er en ferdighet som krever mye trening. Sv?rt f? vil v?re s? begavede fra naturens side at de forst?r programmering bare ved ? skrive av og lese l?sninger. S? godt som alle m? l?re programmering (og regning og andre ferdigheter i realfag) ved ? jobbe p? egenh?nd med et solid antall oppgaver. Mestring er krevende, men betalingen f?r du ved ? kjenne p? mesteringsf?lelsen n?r du mestrer.

Som student er det viktig ? fokusere p? individuelle ferdigheter, alts? at du p? egenh?nd har kunnskap og erfaring til ? l?se nye problemer. Bare p? denne m?ten kan du greie deg senere i studiet og i arbeidslivet, og det gjelder b?de n?r du m? l?se problemer selv og i Öйú¾º²ÂÍø_Öйú×ã²ÊÍø-×ãÇòÍƼö med andre. Uten individuelle ferdigheter har du lite ? bidra med i et Öйú¾º²ÂÍø_Öйú×ã²ÊÍø-×ãÇòÍƼö!